Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UBE2J1Q9Y385 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms