Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms