Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms