Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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