Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms