Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLIP2Q9UDT6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms