Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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