Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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TMEM248Q9NWD8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TMEM248Q9NWD8 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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TMEM248Q9NWD8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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