Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms