Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms