Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms