Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms