Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms