Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG2BQ96BY7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms