Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms