Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms