Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms