Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms