Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SEMA6DQ8NFY4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SEMA6DQ8NFY4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SEMA6DQ8NFY4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SEMA6DQ8NFY4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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