Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KBTBD3Q8NAB2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms