Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN4Q8IWV2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN4Q8IWV2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms