Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms