Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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TRAPPC6BQ86SZ2 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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TRAPPC6BQ86SZ2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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TRAPPC6BQ86SZ2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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TRAPPC6BQ86SZ2 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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