Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG9AQ7Z3C6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG9AQ7Z3C6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG9AQ7Z3C6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9AQ7Z3C6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms