Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms