Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC36A4Q6YBV0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms