Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms