Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms