Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPRIN2Q6IMN6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms