Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms