Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms