Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A12Q504Y0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms