Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms