Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms