Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms