Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC4.28□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP20-2Q3LI61 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms