Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TWISTNBQ3B726 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms