Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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CCDC96Q2M329 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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