Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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