Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SGCAQ16586 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SGCAQ16586 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SGCAQ16586 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SGCAQ16586 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SGCAQ16586 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SGCAQ16586 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SGCAQ16586 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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