Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms