Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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DDB1Q16531 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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DDB1Q16531 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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DDB1Q16531 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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DDB1Q16531 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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DDB1Q16531 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
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DDB1Q16531 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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DDB1Q16531 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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