Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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ZNF56Q15929 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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ZNF56Q15929 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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ZNF56Q15929 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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ZNF56Q15929 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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ZNF56Q15929 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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ZNF56Q15929 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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ZNF56Q15929 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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ZNF56Q15929 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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ZNF56Q15929 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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ZNF56Q15929 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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