Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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