Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms