Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CYTH1Q15438 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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CYTH1Q15438 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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