Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RAB35Q15286 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RAB35Q15286 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RAB35Q15286 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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RAB35Q15286 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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RAB35Q15286 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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RAB35Q15286 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RAB35Q15286 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RAB35Q15286 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RAB35Q15286 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RAB35Q15286 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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