Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PCOLCEQ15113 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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