Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms