Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARHGEF6Q15052 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms